Détails des gènes de l’autisme découverts dans l’étude globale

« Une étude internationale massive a commencé à défaire les« petits détails »de la raison pour laquelle certaines personnes développent l’autisme», rapporte BBC News.

Une équipe de chercheurs internationaux a cherché des variations dans les séquences d’ADN des gènes chez 3 871 personnes atteintes de troubles du spectre autistique (TSA) et 9 937 membres de la famille non affectés ou témoins non apparentés.

Les chercheurs ont identifié 107 gènes contenant des variations associées aux TSA. Chez plus de 5% des personnes atteintes de TSA, ces gènes présentaient de nouvelles mutations (non héréditaires) qui menaient à des gènes qui ne fonctionnaient pas du tout ou fonctionnaient moins bien.

Les gènes codent les protéines impliquées dans la formation synaptique, l’activité (d’expression) d’autres gènes et les protéines impliquées dans la modification de l’encapsidation de l’ADN à l’intérieur des cellules.

Les synapses sont des jonctions où les signaux sont transmis d’une cellule nerveuse à une autre et se trouvent dans le cerveau et le système nerveux. Ils sont considérés comme essentiels pour soutenir la conscience, la pensée et le comportement.

Cette étude apporte plus de lumière sur les TSA, mais ne signifie pas nécessairement que le dépistage de la maladie est plus proche.

Décider si le dépistage est une bonne option implique d’examiner un large éventail de problèmes en plus de déterminer dans quelle mesure les personnes atteintes de TSA peuvent être identifiées, y compris une évaluation des options offertes à une personne identifiée comme étant à risque de TSA.

Par exemple, si le dépistage devait être offert pendant la grossesse, serait-il éthique de mettre fin à une grossesse viable au motif que l’enfant développerait un TSA? Beaucoup de personnes atteintes de TSA mènent une vie enrichissante et enrichissante.

D’où vient l’histoire?

L’étude a été réalisée par une équipe internationale de chercheurs et a été financée par les National Institutes of Health des États-Unis et d’autres sources.

L’étude a été publiée dans la revue scientifique à comité de lecture Nature.

Les reportages différaient en termes de nombre de gènes associés aux TSA; ces chiffres différaient selon ce qu’ils considéraient comme statistiquement significatif. Pour mémoire, il y avait des preuves solides pour 22 gènes et des preuves plus faibles pour 107 autres gènes.

Malgré les gros titres suggérant que le dépistage de l’autisme est plus proche, cela est discutable. L’ASD est une condition très complexe et nous ne comprenons toujours pas complètement ce qui la cause.

Bien que des mutations dans de nombreux gènes aient été associées au trouble, des facteurs environnementaux peuvent également jouer un rôle.

Aucun des médias britanniques ne s’est demandé si le dépistage des TSA serait réellement souhaitable. Comme il n’existe actuellement aucun remède pour les TSA, le dépistage pourrait offrir l’option de mettre fin à une grossesse (ou de rejeter un embryon pour une procédure de FIV).

Cependant, on pourrait soutenir que le dépistage, que ce soit pendant la grossesse ou après la naissance de l’enfant, permettrait aux parents de savoir à quoi s’attendre et que le traitement pourrait commencer peu après la naissance.

De quel type de recherche s’aggissait-t-il?

Il s’agissait d’une étude de cas-témoins qui comparait la séquence des gènes chez les personnes atteintes de TSA (les cas) et chez les témoins, qui étaient soit des membres de la famille, soit des personnes non apparentées. Tous les changements qui ont été trouvés seulement chez les personnes avec TSA, ou chez plus de personnes avec autisme que sans, pourraient contribuer à la condition. Ils ont également examiné si ces variations avaient été héritées par la personne atteinte de TSA d’un de leurs parents, ou s’il s’agissait de «nouvelles» variations qui s’étaient produites au tout début de leur développement.

C’est la conception idéale de l’étude pour identifier les variantes associées aux TSA. C’est une condition complexe, avec de nombreux gènes potentiellement associés à elle – chacun contribuant une petite quantité au risque d’une personne. Les facteurs environnementaux peuvent également jouer un rôle. Différentes personnes atteintes de TSA peuvent avoir différentes combinaisons de facteurs de risque génétiques, et certaines personnes sans la maladie peuvent avoir certains de ces facteurs de risque génétiques. Cette complexité rend très difficile de dire avec certitude que toutes les variations génétiques identifiées contribuent définitivement à la maladie et justifient le dépistage.

Qu’est-ce que la recherche implique?

Les chercheurs ont séquencé toutes les parties des gènes qui contenaient des instructions pour fabriquer des protéines (appelées «l’exome»), et qui reposent sur tous les chromosomes autres que les chromosomes X et Y (appelés «autosomes»).

Ils l’ont fait chez 3 871 personnes atteintes de TSA et 9 937 témoins, et les ont comparées pour rechercher les variations associées aux TSA. Les chercheurs ont noté que c’est le plus grand échantillon jamais étudié de cette façon satisfaction sexuelle.

Les chercheurs ont utilisé de nouvelles méthodes statistiques pour rechercher les variations associées aux TSA. En raison du grand nombre de gènes examinés et des comparaisons multiples en jeu, il existe un risque que certaines des associations statistiquement significatives trouvées soient fausses (par exemple, une association significative est observée lorsqu’aucune association n’existe). Une façon de surmonter ce problème consiste à ajuster les seuils pour ce qui est considéré comme un résultat statistiquement significatif – appelé contrôle du «taux de fausse découverte». Par exemple, définir un taux de découverte erroné de 0,05 signifie que 5% des associations significatives devraient être fausses. Les chercheurs ont examiné quels gènes étaient associés aux TSA en utilisant différents taux de fausses découvertes.

Les chercheurs ont également examiné ce que les gènes avec des variations ont fait dans le corps, pour comprendre comment ils pourraient contribuer à causer les TSA.

Quels ont été les résultats de base?

Les chercheurs ont identifié 22 gènes autosomiques qui étaient associés aux TSA quand ils fixent le seuil, de sorte qu’au moins 95% des associations devraient être vraies (taux de fausses découvertes & lt; 0,05).

33 gènes autosomiques ont été associés aux TSA lorsque le seuil a été fixé, de sorte qu’au moins 90% des associations observées devraient être vraies (taux de fausses découvertes & lt; 0.1). Parmi ces 33 gènes, 15 étaient considérés comme ayant déjà de bonnes preuves d’association avec les TSA, 11 présentaient des preuves d’association antérieures, mais pas aussi fortes, et sept n’avaient jamais été associés à l’autisme auparavant.

Lorsque le seuil a été fixé de manière à ce que l’on s’attende à ce que 70% au moins des associations soient vraies (taux de fausses découvertes <0,30), 107 gènes autosomiques étaient associés aux TSA. Plus de 5% des personnes atteintes de TSA présentaient de nouvelles mutations (non héréditaires) dans ces gènes qui empêchent le gène de fonctionner entièrement ou le font fonctionner moins bien.

Cette étude n’aurait pas identifié tous les gènes associés au risque de TSA, et les chercheurs ont estimé que, selon leurs résultats, il pourrait y avoir 1 150 gènes qui contribuent au risque d’autisme.

Les gènes associés à l’ASD contenaient des instructions pour la fabrication de protéines impliquées dans divers processus, y compris:

faire les jonctions entre les cellules nerveuses (synapses)

changer comment d’autres gènes sont actifs

modifier l’emballage de l’ADN à l’intérieur des cellules

Comment les chercheurs ont-ils interprété les résultats?

Les chercheurs concluent que les personnes atteintes de TSA ont plus de mutations de perte de fonction que ce que l’on pourrait attendre de la population dans son ensemble, et que ces mutations sont concentrées dans une «poignée» de gènes.

Ils disent que leurs résultats suggèrent que les gènes impliqués dans les synapses (jonctions nerveuses), la transcription (activité des gènes) et l’encapsidation de l’ADN sont impliqués dans les TSA.

Conclusion

Cette grande étude a comparé la séquence des gènes chez 3 871 personnes atteintes de TSA avec 9 937 membres de la famille non affectés ou témoins non apparentés.

Dans l’ensemble, 107 gènes autosomiques ont été associés aux TSA, dont environ 30% ne devraient pas être associés à la maladie. Ces gènes présentaient de nouvelles mutations (non héréditaires), entraînant une diminution ou une absence de fonction chez plus de 5% des personnes atteintes de TSA. Les chercheurs ont également estimé que plus de 1000 gènes pourraient contribuer au risque d’autisme. Cela donne une idée de la complexité de la génétique de l’autisme – toutes les personnes atteintes de la maladie ne porteront pas les mêmes facteurs de risque génétiques, et certaines personnes sans la maladie porteront certains de ces facteurs de risque génétiques.

Les chercheurs ont examiné les processus impliqués dans la formation des gènes impliqués. Les gènes impliqués dans la formation synaptique (jonction nerveuse), l’activité (expression) d’autres gènes et les protéines impliquées dans la modification de l’ADN dans les cellules. Cela donne aux chercheurs une idée de ce qui pourrait mal se passer dans les cellules des personnes atteintes de TSA.

Les TSA sont une maladie complexe, et des mutations dans de nombreux gènes ont été associées au trouble, et beaucoup d’autres sont encore à découvrir. Cette étude apporte plus de lumière sur la condition, mais nous avons encore beaucoup à apprendre. Cela signifie que l’utilisation de ce type d’information génétique pour dépister cette condition est peu probable dans un avenir prévisible.

Il y a aussi la possibilité que l’apprentissage de la génétique des TSA mène à de nouveaux traitements.