Commentaire éditorial: Entérocolite nécrosante néonatale: une maladie des Clostridium

Par exemple, une étude basée sur la culture a montré que Clostridia, y compris C butyricum et C perfringens font partie du microbiote commensal chez les prématurés sans entéropathies Cassir et ses collègues ont choisi d’amplifier la région V du gène ARNr S, qui n’est pas le plus fréquemment utilisé mais qui est présentée comme meilleure pour identifier les clostridies en raison de son hypervariabilité. En revanche, Sim et al ont amplifié la région V-V des gènes S ARNr bactériens le fait que, comme déjà observé concernant la détection des bifidobactéries dans le microbiote intestinal, il sera presque impossible de concevoir un seul ensemble d’amorces PCR capable de générer un rendement d’amplification tout aussi efficace des séquences du gène ARNr S dans tous les composants du microbiote intestinal humain La relation entre C butyricum et NEC est renforcée par l’étude de Smith et ses collègues, qui ont récemment rapporté une corrélation entre la présence de C butyricu m et pneumatose intestinale dans des échantillons de tissus de nouveau-nés avec NEC En outre, cette espèce a été largement impliquée dans des études dans les s isolés spécifiquement par culture C butyricum dans le sang, le liquide péritonéal, ou les fèces de nourrissons avec NEC En effet, les cailles gnotobiotiques nourries au lactose et monoassociées au C butyricum présentent des lésions digestives de type NEC De même, un rôle significatif de cette espèce a également été suggéré dans le modèle des porcelets prématurés, où C butyricum ainsi que d’autres espèces clostridiales étaient largement absents chez les porcelets sans NEC et significativement surreprésentés parmi les échantillons de muqueuse colique des porcelets avec NEC Un autre aspect intéressant de l’étude de Cassir et collègues est l’analyse comparative des données de culture et de séquençage des gènes ARNr montre seulement% chevauchement Cela démontre que, comme la culture, les techniques moléculaires sont loin d’identifier la totalité des matières fécales Le microbiote et les approches complémentaires utilisées dans cette étude sont donc nécessaires. La culture bactérienne a permis à Cassir et al de comparer le génome des souches de C butyricum pour le dépistage des caractères de virulence. La pathogénèse de NEC peut être due à une réponse inflammatoire exagérée de l’intestin immature par rapport à un intestin mûr, conduisant à une chimiotaxie des neutrophiles et des lésions tissulaires Divers mécanismes ont été évoqués, par exemple, augmentation de la libération de cytokines pro-inflammatoires comme l’interleukine, défaut des inhibiteurs de la voie nucléaire NF-κB et activation des récepteurs Toll par les lipopolysaccharides Des bactéries gram-négatives Certaines maladies intestinales sont associées à des toxines bactériennes, mais ce n’était pas le cas de NEC. En ce qui concerne Clostridia, la fermentation bactérienne du C butyricum induit des lésions de type NEC dans le modèle CNE des cailles , ou rats perfusés par voie intrarectale Ceci est en accord avec l’hypothèse du rôle clé possible des bactéries une surproduction de bactéries du lactose non digéré due à l’immaturité intestinale des prématurés Un effet de cytotoxicité des surnageants de souche C butyricum a été observé in vitro il y a plusieurs décennies au moyen du butyrate Dans l’article actuel, Cassir et ses collaborateurs Par séquençage du génome entier des souches, ils suggèrent que la cytotoxicité est liée à un gène codant pour un analogue de l’hémolysine de l’agent étiologique de la dysenterie porcine. Cependant, leur conclusion doit être tempérée par: le fait que, premièrement, l’analyse de type séquence in silico multilocus effectuée pour comparer génétiquement les souches de C butyricum a montré des relations clonales entre plusieurs souches de la même unité de soins intensifs néonataux. Les auteurs n’ont pas abordé cet aspect Deuxièmement, l’activité cytotoxique isolées des cas NEC et des témoins. Par conséquent, le potentiel En conclusion, le manuscrit de Cassir et ses collègues ajoute de nouvelles données concernant l’implication de Clostridium dans NEC et met l’accent sur une espèce spécifique, C butyricum. Dans d’autres rapports, NEC était associée à d’autres espèces de Clostridium ou à différentes signatures bactériennes distinctes, par exemple, C perfringens et Klebsiella . Jusqu’à présent, parmi les espèces clostridiales supposées être associées à NEC, aucune ne concernait la production connue de toxine. une espèce toxigénique, n’est pas impliquée dans les NEC Par conséquent, les caractéristiques pathogènes potentielles partagées par ces espèces clostridiales, et peut-être par des bactéries appartenant à d’autres genres, méritent d’être étudiées vertiges. Ces caractéristiques pourraient être spécifiques aux souches bactériennes responsables de la ces espèces appartiennent à un microbiote commensal, ou pourraient interagir avec l’hôte présentant un suscept spécifique la flexibilité

Remarque

Conflits d’intérêts potentiels Les deux auteurs sont impliqués dans le projet EPIFLORE, financé par l’ANR, qui étudie l’établissement bactérien chez les nouveau-nés très prématurés et ses conséquences sanitaires à court et long terme. Les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Les conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués